南少林寺原址历来众说纷纭，争论不休，最终尘埃落定，它坐落于莆田九莲山下，原名林泉院，创建于南北朝的陈朝永定元年（557年）。唐太宗贞观年间，嵩山少林寺僧南下，不远千里来到九莲山，住锡在林泉院。此后，林泉院易名林山少林寺。北宋时，寺庙更加兴旺，僧人500多名，武风极盛，形成南少林拳。与北少林的腿功一起誉称“北腿南拳”。南宋时，寺院仍保留兴旺趋势。刘克庄也盛赞“邑之嵩山少林”。此后，几经兴废，几易其各，而为名寺。林泉院毁于清初。现在南少林寺遗址一带仅存一些附属寺院，如资福寺、红花亭等。1990年4月13日，河南嵩山少林寺方丈德禅大师写下手书:“南少林寺就在福建莆田九莲山下”。中国佛教会会长赵朴初先生题写“南少林寺”寺名。